Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 MBNL1-AS1-202ENST00000608395 6585 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms