Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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USP47Q96K76 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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USP47Q96K76 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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USP47Q96K76 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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USP47Q96K76 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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USP47Q96K76 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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USP47Q96K76 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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USP47Q96K76 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
USP47Q96K76 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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