Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRIQ1Q96JM4 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
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