Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF34Q969K3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms