Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms