Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATL1Q8WXF7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms