Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms