Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms