Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms