Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.7 ms