Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBE2R2Q712K3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms