Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
LRIG3Q6UXM1 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms