Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HMBOX1Q6NT76 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMBOX1Q6NT76 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMBOX1Q6NT76 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMBOX1Q6NT76 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMBOX1Q6NT76 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMBOX1Q6NT76 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMBOX1Q6NT76 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMBOX1Q6NT76 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMBOX1Q6NT76 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMBOX1Q6NT76 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMBOX1Q6NT76 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMBOX1Q6NT76 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMBOX1Q6NT76 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMBOX1Q6NT76 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMBOX1Q6NT76 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMBOX1Q6NT76 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HMBOX1Q6NT76 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMBOX1Q6NT76 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMBOX1Q6NT76 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMBOX1Q6NT76 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms