Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LYSMD4Q5XG99 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms