Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM46CQ5VWP2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms