Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DUSP28Q4G0W2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms