Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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