Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ISXQ2M1V0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms