Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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