Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms