Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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