Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC85BQ15834 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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