Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CST6Q15828 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CST6Q15828 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CST6Q15828 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CST6Q15828 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CST6Q15828 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CST6Q15828 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CST6Q15828 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CST6Q15828 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CST6Q15828 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CST6Q15828 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CST6Q15828 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CST6Q15828 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CST6Q15828 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CST6Q15828 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CST6Q15828 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CST6Q15828 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CST6Q15828 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CST6Q15828 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CST6Q15828 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CST6Q15828 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CST6Q15828 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CST6Q15828 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CST6Q15828 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CST6Q15828 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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