Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCOLCEQ15113 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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