Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCARF1Q14162 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms