Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HTR4Q13639 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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