Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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CDH18Q13634 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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CDH18Q13634 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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CDH18Q13634 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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