Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMAD4Q13485 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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