Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLAMF1Q13291 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms