Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM2Q13029 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms