Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FOXF2Q12947 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FOXF2Q12947 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FOXF2Q12947 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FOXF2Q12947 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FOXF2Q12947 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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FOXF2Q12947 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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FOXF2Q12947 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXF2Q12947 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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