Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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