Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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