Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CXCL9Q07325 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms