Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
FMODQ06828 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FMODQ06828 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FMODQ06828 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms