Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms