Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPP1CAP62136 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPP1CAP62136 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPP1CAP62136 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPP1CAP62136 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PPP1CAP62136 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PPP1CAP62136 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PPP1CAP62136 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PPP1CAP62136 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PPP1CAP62136 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PPP1CAP62136 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms