Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LMO4P61968 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LMO4P61968 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LMO4P61968 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LMO4P61968 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LMO4P61968 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LMO4P61968 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LMO4P61968 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LMO4P61968 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LMO4P61968 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LMO4P61968 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LMO4P61968 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LMO4P61968 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms