Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CABP4P57796 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CABP4P57796 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CABP4P57796 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CABP4P57796 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CABP4P57796 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CABP4P57796 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CABP4P57796 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CABP4P57796 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CABP4P57796 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CABP4P57796 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CABP4P57796 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CABP4P57796 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CABP4P57796 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CABP4P57796 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CABP4P57796 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CABP4P57796 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CABP4P57796 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CABP4P57796 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CABP4P57796 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CABP4P57796 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CABP4P57796 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CABP4P57796 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CABP4P57796 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CABP4P57796 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms