Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC5A3P53794 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms