Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
UBE2E1P51965 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms