Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RANGAP1P46060 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms