Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSOP43234 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSOP43234 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSOP43234 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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