Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRPPRCP42704 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRPPRCP42704 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms