Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FDFT1P37268 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms