Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTX3P26022 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTX3P26022 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTX3P26022 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms