Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PTPRBP23467 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPRBP23467 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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