Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGA6P23229 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms