Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCKDHBP21953 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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