Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNNI3P19429 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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